cours / présentation

Évolution des techniques de séquençage des génomes : quelles implications en informatique ?

Le génome est l’ensemble du matériel génétique d’un individu ou d’une espèce. La séquence d’ADN, qui en est le support, contient l’information nécessaire à la survie des êtres vivants. Le séquençage, qui consiste à déterminer la suite des acides nucléiques qui la composent, est donc un enjeu de soci...

Date de création :

09.03.2017

Auteur(s) :

Arnaud LEFEBVRE

Présentation

Informations pratiques

Langue du document : Français
Type : cours / présentation
Niveau : enseignement supérieur
Durée d'exécution : 1 heure 31 minutes 39 secondes
Contenu : vidéo
Document : video/mp4
Poids : 527.08 Mo
Droits d'auteur : libre de droits, gratuit
Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Université de Rouen Normandie - Tous droits réservés

Description de la ressource

Résumé

Le génome est l’ensemble du matériel génétique d’un individu ou d’une espèce. La séquence d’ADN, qui en est le support, contient l’information nécessaire à la survie des êtres vivants. Le séquençage, qui consiste à déterminer la suite des acides nucléiques qui la composent, est donc un enjeu de société majeur. Les applications sont nombreuses que ce soit dans le domaine médical ou biologique… Les premières techniques de séquençage sont apparues dans la deuxième moitié des années 1970, et ont constamment évolué depuis. Alors que la première version brouillon du génome humain aura mis plus de dix ans à voir le jour au début des années 2000, et aura coûté plusieurs milliards de dollars, il est aujourd’hui possible de faire séquencer son propre génome pour quelques centaines de dollars, et ce, en quelques jours seulement. L’évolution de ces techniques, la quantité d’information générée ont un impact considérable sur les outils et méthodes informatiques nécessaires au stockage et à l’analyse de ces données. Cette présentation s’attachera dans un premier temps à présenter les problématiques informatiques liées au séquençage, ainsi que les différentes solutions apportées au cours de ces dernières décennies, puis conclura sur un certain nombre de problèmes ouverts dans ce domaine.

"Domaine(s)" et indice(s) Dewey

  • Biologie moléculaire - Génétique moléculaire - Biochimie génétique (572.8)
  • ADN - Génomes (572.86)
  • biologie application informatique (570.285)

Domaine(s)

  • Biologie moléculaire
  • Génie Agroalimentaire et Biotechnologique
  • Biologie, biochimie, génétique
  • Biochimie
  • Génétique
  • Biologie moléculaire
  • Biologie
  • Biostatistique
  • Bio-informatique
  • Approche didactique et pédagogique
  • Approche scientifique - Recherche
  • Entretiens, portraits, itinéraires
  • Outils, méthode et techniques scientifiques

Document(s) annexe(s)

Fiche technique

Identifiant de la fiche : 33641
Identifiant OAI-PMH : oai:canal-u.fr:33641
Schéma de la métadonnée : oai:uved:Cemagref-Marine-Protected-Areas
Entrepôt d'origine : Canal-U

Voir aussi

UNIT
UNIT
22.03.2004
Description : À l’interface entre biologie, informatique et mathématiques, la bioinformatique analyse et interprète, au moyen de méthodes informatiques, les données biologiques que sont les séquences des gènes et des protéines cellulaires.
  • banque de données
  • banque de séquences
  • séquençage du génome
  • génomique
  • fuscia
UNIT
UNIT
18.03.2004
Description : Une molécule d’ADN est une longue chaîne, une succession de nucléotides dont l’ordre – la séquence – permet de coder l’information génétique de chaque organisme vivant. Cette séquence est au centre de la génomique.
  • génome
  • séquençage du génome
  • codon
  • annotation de séquence
  • fuscia