cours / présentation

Algorithmes et génomes : analyse informatique de l'information génétique : 1ere partie

La séquence de caractères est un des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la problématique de l’analyse des séquences géno...

Date de création :

23.11.2011

Auteur(s) :

Francois RECHENMANN

Présentation

Informations pratiques

Langue du document : Français
Type : cours / présentation
Niveau : formation continue
Durée d'exécution : 1 heure 22 minutes 59 secondes
Contenu : vidéo
Document : video/mp4
Poids : 377.41 Mo
Droits d'auteur : libre de droits, gratuit
Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs.

Description de la ressource

Résumé

La séquence de caractères est un des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la problématique de l’analyse des séquences génomiques. Cet exposé décrit quelques exemples d’algorithmes simples dont l’application contribue à l’analyse de génomes et à la compréhension de l’évolution des organismes qui les portent... ...La bioinformatique fait appel à de très nombreux domaines de l’informatique et des mathématiques : algorithmique sur les séquences, les arbres ou les graphes, modèles probabilistes, modèles dynamiques, bases de données et de connaissances, visualisation d’ensembles de données complexes, etc. De ce fait, le principe, à travers la bioinformatique, d’une introduction conjointe à l’algorithmique et à la génomique mériterait sans aucun doute d’être exploré. Une conférence donnée dans le cadre du cycle de conférences organisées par Inria Grenoble Rhône Alpes et l' Académie de Grenoble pour accompagner l'enseignement de l'informatique au lycée.

"Domaine(s)" et indice(s) Dewey

  • Simulation informatique (003.3)
  • Biologie moléculaire - Génétique moléculaire - Biochimie génétique (572.8)
  • Algorithmes (518.1)

Domaine(s)

  • Modélisation et simulation par ordinateur
  • Modelisation et simulation
  • Biologie moléculaire
  • Génie Agroalimentaire et Biotechnologique
  • Biologie, biochimie, génétique
  • Biochimie
  • Génétique
  • Analyse numérique
  • Programmation : Algorithmique, langages, conception objet, programmes
  • Analyse numérique appliquée, calcul numérique, mathématiques numériques

Intervenants, édition et diffusion

Intervenants

Fournisseur(s) de contenus : MANHATTAN STUDIO PRODUCTIONS M.S.P.

Édition

  • INRIA (Institut national de recherche en informatique et automatique)
  • Académie de Grenoble

Diffusion

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Document(s) annexe(s)

Fiche technique

Identifiant de la fiche : 8184
Identifiant OAI-PMH : oai:canal-u.fr:8184
Schéma de la métadonnée : oai:uved:Cemagref-Marine-Protected-Areas
Entrepôt d'origine : Canal-U

Voir aussi

Canal-U
Canal-U
23.11.2011
Description : La séquence de caractères est un des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la problématique de l’analyse des séquences ...
  • algorithme
  • bioinformatique
  • analyse de génome
  • séquence génomique
Canal-U
Canal-U
10.06.2009
Description : Dans cet exposé François Rechenmann propose un rapide survol des méthodes algorithmiques utilisées au niveau de l'analyse du génome. On y découvre que l'informatique est à la fois un outil incontournable, puisque seules des méthodes algorithmiques automatiques issus de travaux sur le traitement ...
  • biologie
  • dynamique des populations
  • bioinformatique
  • alignement de séquences
  • analyse statistique
  • système dynamique
  • phylogénétique
  • représentation des données
  • algorithmique
  • simulation
  • génome
  • évolution
  • région codante