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cours / présentation, démonstration
Alignement optimal et comparaison de séquences génomiques et protéiques
La comparaison de séquences génomiques et protéiques est la tâche informatique la plus exécutée par les biologistes. Des algorithmes sont mis en œuvre pour calculer les meilleurs alignements entre plusieurs séquences. ...
Date de création :
03.01.2005Auteur(s) :
François Rechenmann
Présentation
Informations pratiques
Langue du document : Français
Type : cours / présentation, démonstration
Niveau : enseignement supérieur
Langues : Français
Contenu : texte, image, ressource interactive
Public(s) cible(s) : apprenant
Document : Document HTML
Age attendu : 18+
Droits d'auteur : pas libre de droits, gratuit
Ce document est diffusé sous licence Creative Common : Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/fr/legalcode
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Description de la ressource
Résumé
La comparaison de séquences génomiques et protéiques est la tâche informatique la plus exécutée par les biologistes. Des algorithmes sont mis en œuvre pour calculer les meilleurs alignements entre plusieurs séquences.
- Granularité : grain
- Structure : atomique
"Domaine(s)" et indice(s) Dewey
- (511.8)
Domaine(s)
- Informatique théorique
- Généralités, philosophie, théorie des mathématiques
- Fondamentaux et modèles mathématiques
- Principes généraux
Intervenants, édition et diffusion
Intervenants
Créateur(s) de la métadonnée : Marie-Hélène Comte
Édition
- Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique / Interstices
Diffusion
Cette ressource vous est proposée par :
Fiche technique
Identifiant de la fiche : http://ori.unit-c.fr/uid/unit-ori-wf-1-4409
Identifiant OAI-PMH : oai:www.unit.eu:unit-ori-wf-1-4409
Statut de la fiche : final
Schéma de la métadonnée : oai:uved:Cemagref-Marine-Protected-Areas
- LOMv1.0
- LOMFRv1.0
- SupLOMFRv1.0
- Voir la fiche XML
Entrepôt d'origine : UNIT
Voir aussi
28.11.2006
Description
:
Les algorithmes de compression de données permettent de classer automatiquement toutes sortes de fichiers. Ce « classement » est d’autant plus pertinent que ces algorithmes sont performants.
- distance de similarité
- algorithme de compression
- complexité de Kolmogorov
- arbre phylogénétique
- calcul réversible
- fuscia
16.03.2010
Description
:
L’efficacité actuelle des techniques de séquençage de l’ADN permet des projets à grande échelle. François Rechenmann en parle dans cet épisode du podcast audio.
- podcast
- séquençage du génome
- ADN
- comparaison de séquence
- banque de séquences
- fuscia