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Sommaire

cours / présentation, démonstration

Analyser les génomes des océans

Grâce aux techniques de séquençage de l’ADN, nous avons aujourd’hui les moyens technologiques de connaitre le génome des organismes vivants, le plancton des océans y compris. Mais est-ce si simple ? Comment extraire de l’information biologique de gigantesques masses de données contenant des fragment...

Date de création :

05.09.2019

Auteur(s) :

Pierre Peterlongo

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Présentation

Informations pratiques

Langue du document : Français
Type : cours / présentation, démonstration
Niveau : enseignement supérieur
Langues : Français
Contenu : texte, image, ressource interactive
Public(s) cible(s) : apprenant
Document : Document HTML
Age attendu : 18+
Droits d'auteur : pas libre de droits, gratuit
Ce document est diffusé sous licence Creative Commons : Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/fr/legalcode

Description de la ressource

Résumé

Grâce aux techniques de séquençage de l’ADN, nous avons aujourd’hui les moyens technologiques de connaitre le génome des organismes vivants, le plancton des océans y compris. Mais est-ce si simple ? Comment extraire de l’information biologique de gigantesques masses de données contenant des fragments des génomes des organismes vivants dans les océans ? Comment développer un outil informatique pertinent mais assez simple et rapide pour venir à bout de plusieurs téraoctets de données brutes ? Faisons le point sur un projet algorithmique qui a vu le jour grâce aux données générées par l’expédition Tara Ocean.

  • Granularité : grain
  • Structure : atomique

"Domaine(s)" et indice(s) Dewey

  • (003)
  • (570)

Domaine(s)

  • Fondamentaux : Théorie des systèmes, simulation informatique des systèmes
  • Biologie
  • Biologie, biochimie, génétique
  • Approche didactique et pédagogique
  • Approche scientifique - Recherche
  • Entretiens, portraits, itinéraires
  • Outils, méthode et techniques scientifiques

Intervenants, édition et diffusion

Intervenants

Créateur(s) de la métadonnée : Valérie François

Édition

  • Inria / Interstices

Diffusion

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Fiche technique

Identifiant de la fiche : http://ori.unit-c.fr/uid/unit-ori-wf-1-7345
Identifiant OAI-PMH : oai:www.unit.eu:unit-ori-wf-1-7345
Statut de la fiche : final
Schéma de la métadonnée : oai:uved:Cemagref-Marine-Protected-Areas
Entrepôt d'origine : UNIT

Publication : 22.05.2015

séquençage ADN
bioinformatique
extraction information
génome
algorithme

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  • génome humain
  • séquençage ADN
  • données génomiques
  • méthodes algorithmiques
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  • fuscia