Le MESRI assure depuis de nombreuses années l'expertise des candidatures aux programmes de coopération bilatérale internationale comme les Partenariats Hubert Curien ou est associé à certains autres programmes bilatéraux (ECOS, COFECUB...). Cette expertise est assurée par le PEI (Pôle Expertise Internationale) qui est intégré au Département Stratégie, expertise et gestion de programmes internationaux à la Délégation aux Affaires Européennes et Internationales (DAEI). Le PEI s'appuie sur 250 experts scientifiques nationaux tous domaines confondus et 10 grands experts sectoriels.
